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[Material Studio|MS]计算氢键

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发表于 2023-6-11 12:56:09 | 显示全部楼层 |阅读模式
氢键是由一个带有部分正电荷的氢原子与一个带有部分负电荷的原子(如氧、氮、硫等)之间的弱相互作用力形成的。在质谱分析中,氢键可以影响分子的离子化和碎片化过程。由于氢键的存在,分子中的某些原子可能会更难被电离,因此产生的离子信号可能会减弱或消失。此外,氢键还可以影响分子的碎裂模式,导致不同的离子片段产生
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 楼主| 发表于 2023-6-11 12:56:31 | 显示全部楼层
从菜单中选择 Build|Hydrogen Bonds。
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 楼主| 发表于 2023-6-11 14:19:12 | 显示全部楼层
Atomsk建模软件
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 楼主| 发表于 2023-6-11 14:36:46 | 显示全部楼层
绘制苯环
选择绘制环工具,并在文档中绘制一个 6 元环。注意当你在绘制的同时按下 Alt 键,会
绘制带虚线的六元环,
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 楼主| 发表于 2023-6-11 14:37:33 | 显示全部楼层
编辑原子类型 修改原子
选中某个原子后,在 Modify 菜单下的 Modify Element 中选择 Oxygen 来改变原子类型。
或者可以在 Sketch 工具栏中选择 Modify Element 按钮来直接改变原子类型
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 楼主| 发表于 2023-6-11 14:58:40 | 显示全部楼层
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 楼主| 发表于 2023-6-11 16:26:43 | 显示全部楼层
如果分子不是刚性分子需要进行构象分析
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 楼主| 发表于 2023-6-11 23:21:13 | 显示全部楼层
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 楼主| 发表于 2023-6-11 23:27:25 | 显示全部楼层
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